流域生態環境規劃管理系統是流域生態環境管理決策的重要工具，是實施流域可持續發展戰略科學直觀的支持系統。目前我國七大流域中，長江、黃河、松花江、海河這四大流域已經建立了本系統，在流域生態環境規劃與管理中發揮了重要作用。

         系統以地理信息系統為集成平臺，融合大型數據庫和模型計算技術，實現了GIS與流域生態環境管理系統的一體化。

         系統包括了流域生態環境功能區劃、生態環境現狀分析、流域污染物排放總量控制分析、水質模擬計算分析、生態環境變化趨勢分析、流域環保投資項目分布與效益分析等決策支持功能，同時具有實時水質評價、國家環境標準查詢、水期確定多種輔助管理工具。

         流域管理決策支持功能

         生態環境功能區劃

         在自然地理條件的基礎上，結合行政管理的要求，劃分流域生態功能區和水環境功能區。在GIS地圖上，分規劃區、控制區、控制單元三個層次進行演示。

         生態環境現狀分析

         在生態環境功能分區的基礎上，利用數據和圖象交互式描述與分析各功能區的生態環境特征；通過河流顏色分級形象顯示整個流域的水環境狀況。

         流域污染物排放總量控制分析

         污染物排放總量控制是我國環境保護政策的一項重要措施。從流域的角度出發，顯示各個規劃區、控制區的污染物排放現狀和實現環境規劃目標的總量控制方案；為便于管理實施，把流域要求歸并到行政區，實現省級和地市級的量化污染控制，并顯示省和地市的總量控制方案。

         水質模擬計算分析

         水質模擬是分析污染源和環境質量影響的重要手段。在現有資料的基礎上建立各河段的水質模型，可以計算河流環境容量，模擬各種條件下的環境影響結果。